9月24日下午,中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心舉辦了“可溯源的代謝組數(shù)據(jù)分析平臺(tái)”培訓(xùn),旨在幫助科研人員了解和掌握代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的關(guān)鍵技術(shù)和方法。本次培訓(xùn)由中心陳衛(wèi)博士擔(dān)任主講人。
培訓(xùn)伊始,陳衛(wèi)系統(tǒng)地介紹了代謝組學(xué)的基本概念、當(dāng)前研究現(xiàn)狀以及面臨的挑戰(zhàn)。隨后,他重點(diǎn)講解了代謝組數(shù)據(jù)分析平臺(tái)的設(shè)計(jì)理念、主要功能模塊及其具體應(yīng)用。該平臺(tái)具備全面的數(shù)據(jù)處理能力,能夠處理來(lái)自不同質(zhì)譜儀器的大規(guī)模原始數(shù)據(jù),支持格式轉(zhuǎn)換、峰提取、代謝物鑒定等核心步驟。平臺(tái)提供了包括單變量統(tǒng)計(jì)(如t-test, ANOVA)和多變量統(tǒng)計(jì)(如PCA, PLS-DA, OPLS-DA)在內(nèi)的多種方法,用于篩選差異代謝物。還通過(guò)完善的功能分析工具,確保所有操作均可溯源,實(shí)現(xiàn)了高度的數(shù)據(jù)透明性和可重復(fù)性,增強(qiáng)了研究結(jié)果的可信度。最后,陳博士還現(xiàn)場(chǎng)演示了如何利用平臺(tái)進(jìn)行實(shí)際數(shù)據(jù)分析,包括從數(shù)據(jù)上傳到結(jié)果解讀的全過(guò)程。
培訓(xùn)過(guò)程中,學(xué)員們積極參與,踴躍發(fā)言,并與主講人就溯源功能的作用、無(wú)二級(jí)質(zhì)譜文件的情況下如何用二維表格文件進(jìn)行注釋、以及平臺(tái)中各個(gè)功能是否可以單獨(dú)運(yùn)行等問(wèn)題進(jìn)行了深入交流和討論。通過(guò)此次培訓(xùn),科研人員不僅加深了對(duì)代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析的理解,還學(xué)會(huì)了如何高效利用所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心提供的平臺(tái),提升了研究效率和數(shù)據(jù)分析的準(zhǔn)確性。
代謝組學(xué)是研究生物體內(nèi)源性代謝物的整體對(duì)內(nèi)因或者外因編號(hào)應(yīng)答規(guī)律的重要學(xué)科,其在生物學(xué)功能研究及臨床疾病診斷中扮演著關(guān)鍵角色。然而,傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析流程往往存在運(yùn)算能力不足、參數(shù)記錄不完整、軟件工具分散等問(wèn)題,限制了研究的進(jìn)展。為解決這些問(wèn)題,營(yíng)養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心特別開(kāi)發(fā)了一個(gè)集易用性、功能性、計(jì)算能力和可溯源于一體的代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分析平臺(tái)(https://www.biosino.org/metabolome-analysis/)
營(yíng)養(yǎng)與健康所所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心將持續(xù)舉辦相關(guān)主題的培訓(xùn)活動(dòng),以幫助更多的科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務(wù)。同時(shí),所級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心還設(shè)計(jì)了相關(guān)的調(diào)研問(wèn)卷(詳見(jiàn)文末二維碼),誠(chéng)邀科研人員提出寶貴的意見(jiàn)和建議,以便進(jìn)一步優(yōu)化和提升服務(wù)質(zhì)量。通過(guò)與科研人員的積極互動(dòng)和反饋,中心將不斷改進(jìn)服務(wù)流程,提升技術(shù)支持質(zhì)量,為進(jìn)一步滿足科研需求提供更加優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。

陳衛(wèi)博士作培訓(xùn)報(bào)告

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