2019年7月3日,國際著名學(xué)術(shù)期刊Cell Stem Cell在線發(fā)表了題為“A Homeostatic Arid1a-Dependent Permissive Chromatin State Licenses Hepatocyte Responsiveness to Liver-Injury-Associated YAP Signaling”的研究論文。該研究由中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心惠利健研究組與中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所李亦學(xué)研究組合作完成。該研究發(fā)現(xiàn)染色體重塑調(diào)控蛋白Arid1a介導(dǎo)肝細(xì)胞重編程基因在正常的肝細(xì)胞中預(yù)打開,使肝細(xì)胞具有響應(yīng)損傷誘導(dǎo)的YAP信號而轉(zhuǎn)錄激活重編程基因的潛能,揭示了肝細(xì)胞去分化可塑性的分子基礎(chǔ)。
李亦學(xué)研究組長期從事組學(xué)大數(shù)據(jù)相關(guān)的算法開發(fā)和數(shù)據(jù)挖掘,并將其應(yīng)用于腫瘤等復(fù)雜疾病的研究。在這項最新的研究進展中,研究團隊通過構(gòu)建肝細(xì)胞中Arid1a敲除的缺陷小鼠,發(fā)現(xiàn)Arid1a缺失會抑制肝臟損傷修復(fù)。鑒于Arid1a作為染色質(zhì)重塑復(fù)合體的重要組分,科研人員通過ATAC-seq技術(shù)研究染色質(zhì)開放區(qū)域。發(fā)現(xiàn)在肝臟正常狀態(tài)時,Arid1a通過賦予肝細(xì)胞重編程基因染色質(zhì)預(yù)打開的狀態(tài),幫助肝細(xì)胞能夠快速應(yīng)對損傷信號,避免劇烈的染色質(zhì)重塑。同時結(jié)合ChIP-seq和RNA-seq,科研人員識別了轉(zhuǎn)錄因子Yap響應(yīng)Arid1a介導(dǎo)的肝細(xì)胞重編程過程,Yap與肝細(xì)胞重編程基因結(jié)合,轉(zhuǎn)錄激活肝細(xì)胞重編程基因的表達,使肝細(xì)胞具有響應(yīng)Hippo/Yap信號通路的分子基礎(chǔ)。
中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心(生化與細(xì)胞研究所)李維平博士、博士研究生何強和中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所楊力光博士為該論文共同第一作者,分子細(xì)胞中心惠利健研究員,營養(yǎng)與健康研究所李亦學(xué)研究員、李虹副研究員為共同通訊作者。該工作得到第二軍醫(yī)大學(xué)附屬長征醫(yī)院謝渭芬課題組的大力支持,并獲中科院、基金委、科技部、上海市科委等資助。
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圖:Ardi1a調(diào)控?fù)p傷誘導(dǎo)的肝細(xì)胞重編程機制